Evaluación de una técnica de PCR-múltiple para la detección rápida de salmonella typhimurium y enteritidis en cuyes (Cavia porcellus) naturalmente infectados

Gerardo Díaz; Rosadio A. Raúl; Marcelo M. Geraldine; Chero O. Ana; Jiménez A. Ronald; Reyna W. Iván; Maturrano H. Lenin

doi:10.15381/rivep.v28i3.13361

Evaluación de una técnica de PCR-múltiple para la detección rápida de salmonella typhimurium y enteritidis en cuyes (Cavia porcellus) naturalmente infectados

Translated title of the contribution: Evaluation of a multiplex-PCR method for rapid detection of salmonella typhimurium and enteritidis in naturally infected Guinea pigs (cavia porcellus)

Gerardo Díaz, Rosadio A. Raúl, Marcelo M. Geraldine, Chero O. Ana, Jiménez A. Ronald, Reyna W. Iván, Maturrano H. Lenin

Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

Abstract

The aim of this study was to evaluate the detection capacity of the Multiplex Polymerase Chain Reaction (PCR) method from non-selective pre-enrichment samples (using target sequences of InvA, fliC and prot6E genes) to diagnose Salmonella Typhimurium and Enteritidis and to determine the concordance between the conventional microbiological detection method which consist of non-selective pre-enrichment, selective enrichment, differential agar isolation and biochemical tests. A total of 111 liver samples from Guinea pigs with presumptive diagnosis of salmonellosis, collected in Chancay (Lima) and El Mantaro (Junín), Peru were analyzed. Salmonella Typhimurium was detected by multiplex PCR in 54% (60/111) of the samples and by microbiological analysis in 41% (45/111). A substantial concordance was found with a Kappa value of 0.64. The McNemar test showed that the results of both tests were statistically different (p<0.05).

Translated title of the contribution	Evaluation of a multiplex-PCR method for rapid detection of salmonella typhimurium and enteritidis in naturally infected Guinea pigs (cavia porcellus)
Original language	Spanish
Pages (from-to)	713-722
Number of pages	10
Journal	Revista de Investigaciones Veterinarias del Peru
Volume	28
Issue number	3
DOIs	https://doi.org/10.15381/rivep.v28i3.13361
State	Published - 1 Jul 2017

Bibliographical note

Funding Information:
La toma de muestras se llevó a cabo en la estación experimental «El Mantaro» del Instituto Veterinario de Investigaciones de Trópico y Altura (IVITA) de la Facultad de Medicina Veterinaria, Universidad Nacional Mayor de San Marcos (FMV-UNMSM) (Jauja, Perú), y en un criadero de crianza comercial en Chancay(Huaral,Perú). El pro-cesamiento de las muestras se llevó a cabo en el laboratorio de Genética y Biología Molecular de la FMV-UNMSM en Lima. Ambas etapas se ejecutaron entre octubre de 2015 y abril de 2016.

Funding Information:
Este estudio fue financiado por el Pro- grama Nacional de Innovación para la Competitividad y Productividad - Innóvate Perú, del Proyecto Contrato 362-PNICP-PIAP-2014 «Desarrollo de una vacuna para el control y prevención de la salmonelosis en la producción cuyes».

Access to Document

10.15381/rivep.v28i3.13361

Cite this

Díaz, G., Raúl, R. A., Geraldine, M. M., Ana, C. O., Ronald, J. A., Iván, R. W., & Lenin, M. H. (2017). Evaluación de una técnica de PCR-múltiple para la detección rápida de salmonella typhimurium y enteritidis en cuyes (Cavia porcellus) naturalmente infectados. Revista de Investigaciones Veterinarias del Peru, 28(3), 713-722. https://doi.org/10.15381/rivep.v28i3.13361

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keywords = "Guinea pig, Microbiological isolation, Multiplex PCR, Rapid detection, Salmonella",

author = "Gerardo D{\'i}az and Ra{\'u}l, {Rosadio A.} and Geraldine, {Marcelo M.} and Ana, {Chero O.} and Ronald, {Jim{\'e}nez A.} and Iv{\'a}n, {Reyna W.} and Lenin, {Maturrano H.}",

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issn = "1682-3419",

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Díaz, G, Raúl, RA, Geraldine, MM, Ana, CO, Ronald, JA, Iván, RW & Lenin, MH 2017, 'Evaluación de una técnica de PCR-múltiple para la detección rápida de salmonella typhimurium y enteritidis en cuyes (Cavia porcellus) naturalmente infectados', Revista de Investigaciones Veterinarias del Peru, vol. 28, no. 3, pp. 713-722. https://doi.org/10.15381/rivep.v28i3.13361

Evaluación de una técnica de PCR-múltiple para la detección rápida de salmonella typhimurium y enteritidis en cuyes (Cavia porcellus) naturalmente infectados. / Díaz, Gerardo; Raúl, Rosadio A.; Geraldine, Marcelo M. et al.

In: Revista de Investigaciones Veterinarias del Peru, Vol. 28, No. 3, 01.07.2017, p. 713-722.

Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

TY - JOUR

T1 - Evaluación de una técnica de PCR-múltiple para la detección rápida de salmonella typhimurium y enteritidis en cuyes (Cavia porcellus) naturalmente infectados

AU - Díaz, Gerardo

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N1 - Funding Information: La toma de muestras se llevó a cabo en la estación experimental «El Mantaro» del Instituto Veterinario de Investigaciones de Trópico y Altura (IVITA) de la Facultad de Medicina Veterinaria, Universidad Nacional Mayor de San Marcos (FMV-UNMSM) (Jauja, Perú), y en un criadero de crianza comercial en Chancay(Huaral,Perú). El pro-cesamiento de las muestras se llevó a cabo en el laboratorio de Genética y Biología Molecular de la FMV-UNMSM en Lima. Ambas etapas se ejecutaron entre octubre de 2015 y abril de 2016. Funding Information: Este estudio fue financiado por el Pro- grama Nacional de Innovación para la Competitividad y Productividad - Innóvate Perú, del Proyecto Contrato 362-PNICP-PIAP-2014 «Desarrollo de una vacuna para el control y prevención de la salmonelosis en la producción cuyes».

PY - 2017/7/1

Y1 - 2017/7/1

N2 - The aim of this study was to evaluate the detection capacity of the Multiplex Polymerase Chain Reaction (PCR) method from non-selective pre-enrichment samples (using target sequences of InvA, fliC and prot6E genes) to diagnose Salmonella Typhimurium and Enteritidis and to determine the concordance between the conventional microbiological detection method which consist of non-selective pre-enrichment, selective enrichment, differential agar isolation and biochemical tests. A total of 111 liver samples from Guinea pigs with presumptive diagnosis of salmonellosis, collected in Chancay (Lima) and El Mantaro (Junín), Peru were analyzed. Salmonella Typhimurium was detected by multiplex PCR in 54% (60/111) of the samples and by microbiological analysis in 41% (45/111). A substantial concordance was found with a Kappa value of 0.64. The McNemar test showed that the results of both tests were statistically different (p<0.05).

AB - The aim of this study was to evaluate the detection capacity of the Multiplex Polymerase Chain Reaction (PCR) method from non-selective pre-enrichment samples (using target sequences of InvA, fliC and prot6E genes) to diagnose Salmonella Typhimurium and Enteritidis and to determine the concordance between the conventional microbiological detection method which consist of non-selective pre-enrichment, selective enrichment, differential agar isolation and biochemical tests. A total of 111 liver samples from Guinea pigs with presumptive diagnosis of salmonellosis, collected in Chancay (Lima) and El Mantaro (Junín), Peru were analyzed. Salmonella Typhimurium was detected by multiplex PCR in 54% (60/111) of the samples and by microbiological analysis in 41% (45/111). A substantial concordance was found with a Kappa value of 0.64. The McNemar test showed that the results of both tests were statistically different (p<0.05).

KW - Guinea pig

KW - Microbiological isolation

KW - Multiplex PCR

KW - Rapid detection

KW - Salmonella

UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=85040361948&partnerID=8YFLogxK

U2 - 10.15381/rivep.v28i3.13361

DO - 10.15381/rivep.v28i3.13361

M3 - Artículo

AN - SCOPUS:85040361948

SN - 1682-3419

VL - 28

SP - 713

EP - 722

JO - Revista de Investigaciones Veterinarias del Peru

JF - Revista de Investigaciones Veterinarias del Peru

IS - 3

ER -

Evaluación de una técnica de PCR-múltiple para la detección rápida de salmonella typhimurium y enteritidis en cuyes (Cavia porcellus) naturalmente infectados

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